Как можно вмешиваться в работу советника?

Вмешиваться не рекомендуется.

Почти без последствий можно закрыть усредняющие ордера. От остальный сделок они отличаются комментарием “average” и magic номером указанным в настройках.

Вмешательство в рыночные ордера приведет к открытию новых сделок. Советник будет всегда пытаться выровнять лок.

Если будет закрыта убыточная сделка, а по оставшимся прибыль будет выше той что указана в параметрах для закрытия, то советник решит что он отыграл убытки и закроет все ордера.